中草藥材的干燥品種有很多，不同的中草藥材要選用不同的干燥方式，對于不易干燥或易于腐敗變質的中草藥，如當歸經過傳統的日曬后皮色變紅，品質下降。而人們會選用傳統的硫熏干燥，傳統的硫熏干燥在干燥過程中會產生對人體有害的高濃度二氧化硫，導致經過處理的中藥材存在二氧化硫殘留并危及生命，需要予以禁止。但由于二氧化硫具有防腐、防蟲、漂白、保水等功效，經此方法處理后的中藥材皮質光滑、顏色白潤、外形規整，同時，二氧化硫還原性強，與含有羥基活性激素的藥材發生化學反應，進而改變中草藥原有的某些化學成分，影響中草藥效果，使得中草藥的品質發生改變。因此，此方法在我國某些地方還在采用。
二、不合理干燥
在中草藥材的干燥過程中，由于種類與性質不同，不同的藥材要選用適宜的干燥方式，否則會影響中藥材的品質。例如在中草藥干燥方法中，溫度的變化是影響因素，中藥材中含揮發油時，
干燥溫度不宜過高，過高使得揮發油散失，造成有效成分被破壞，除此之外，還要避免高溫操作造成某些熱敏性有效成分的大量分解，例如包含維生素、酶類等物質的中草藥。干燥過程中的溫度、時間對中藥材質量也有影響，如當溫度升高、時間加長時，鮮地黃梓醇含量逐漸減少。
因此，在中草藥材的干燥過程中，通常采用含水量、形狀、色澤來確定中草藥的烘干工藝，合理的中草藥材烘干工藝，主要體現在烘干過程中的干燥速度、干燥介質的流速、溫度、濕度。合理的中草藥材烘干工藝，可以保證中草藥材的形態和色澤和質地，并減少烘干過程中的污染，中草藥材烘干后的效益增加。
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